1、世界观上，崩坏星穹铁道背景建立在宇宙之上，主教团石碑列车选中的乘客，可在不同的世界里穿梭，并维持即将崩坏的宇宙。崩坏3上，主要建立在处于崩坏的星球上，两者之间区别还是很大的。
2、崩坏星穹铁道的宇宙旅行指的是在虚数之树的躯干上，而崩三主线发生的世界是这个平行宇宙的一环。简单来说，苍穹世界观隶属于崩坏本家的虚数之树和量子之海里面。
3、角色上，崩坏星穹铁道和崩坏三之间没有任何关系，因此崩坏星穹铁道并不是崩坏3的续作，而是类似于平行世界的版本。
总的来说，崩坏星穹铁道和崩坏三关系还是比较复杂的，有结合更有出入，但却不是续作，这是玩家需要知晓的。
